Năm 2001, tập thể các nhà giáo, nhà khoa học, nhà quản lý, nhà đầu tư có tâm huyết với sự nghiệp “Trồng người” có ý tưởng thành lập trường Đại học Yersin Đà Lạt trên địa bàn thành phố Đà Lạt và đã cùng nhau góp vốn liếng, công sức, trí tuệ để xây dựng nên ngôi trường này.

Đến ngày 01 tháng 10 năm 2004, Thủ tướng Chính phủ đã ký Quyết định số 175/2004/QĐ-TTg thành lập trường Đại học Yersin Đà Lạt. Nhà trường đã tổ chức lễ công bố quyết định này vào ngày 27/12/2004 và lấy ngày 27/12 hàng năm là ngày truyền thống của trường. Trường Đại học Yersin Đà Lạt được thành lập là cơ sở đào tạo đại học ngoài công lập đầu tiên trên vùng đất Tây Nguyên.